Развитие туберкулезной инфекции вызывают 4 вида микобактерий:

Однако в патогенезе туберкулеза у человека ведущая роль принадлежит именно Mycobacterium tuberculosis. В конеце XX и начало XXI века значительно увеличилось число людей страдающими заболеванием туберкулез. Во всем мире: каждый год регистрируют около 8 миллионов новых случаев этого тяжелого заболевания, около 3 миллионов человек каждый год умирает от туберкулеза. Изменился и характер течения болезни; с каждым годом наблюдается рост случаев первичного туберкулеза, вызванного штаммами, устойчивыми к одному или нескольким антимикобактериальным препаратам. Лечение таких больных невозможно по обычным схемам антибиотикотерапии; инфекционный процесс часто протекает тяжело и скоротечно. Важной стороной контроля за распространением инфекции является типирование штаммов микобактерий туберкулеза как внутри стационаров, так и внутри определенных географических регионов.

Рутинная диагностика и типирование микобактерий туберкулеза микробиологическими методами занимает от 3 недель до 3 месяцев, что негативно сказывается на эффективности терапии. Поэтому в последние десятилетия интенсивно развиваются молекулярно-генетические методы диагностики туберкулеза, определения лекарственной устойчивости и типирования штаммов микобактерий туберкулеза.

ПЦР - диагностика туберкулеза как правило строится на использовании последовательностей ДНК специфичных для всех 4 видов группы туберкулеза. Часто для этих целей используют праймеры для выявления последовательностей IS-элементов, например, IS-986 или IS-6110, поскольку данные мигрирующие элементы характерны только для видов микобактерий группы туберкулеза и присутствуют в геноме микобактерий в числе нескольких копий. Выделение ДНК из чистых культур и клинических образцов (мокроты больных) возможно осуществлять любым приемлемым методом, например, методом Boom с использованием лизирующего буфера на основе гуанидина тиоционата и двуокиси кремния в качестве носителя ДНК.