Мокроту, свежевыделенную, полученную путём откашливания, собирают в стерильную посуду и сразу направляют на исследование. Перед сбором мокроты больной должен тщательно вычистить зубы, тщательно прополоскать водой рот и глотку. Необходимо следить, чтобы в склянку не попадала носоглоточная слизь (особенно при насморке). Собирать мокроту можно в любое время суток, когда она выделяется у больного. До исследования её обязательно хранить в холодильнике при температуре +4°С, но не ниже 0°С.